| 22. Journée | 27.01.2024 | FC Annecy | - | Pau FC | 0:0 | ||||
| 23. Journée | 03.02.2024 | EA Guingamp | - | FC Annecy | 1:4 |  |
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| 24. Journée | 10.02.2024 | FC Annecy | - | US Concarneau | 0:3 |  |
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| 26. Journée | 24.02.2024 | AS Saint-Étienne | - | FC Annecy | 2:1 | ||||
| 27. Journée | 02.03.2024 | FC Annecy | - | US Quevilly-Rouen | 0:0 | ||||
| 28. Journée | 09.03.2024 | AC Ajaccio | - | FC Annecy | 1:3 | ||||
| 29. Journée | 16.03.2024 | FC Annecy | - | Girondins Bordeaux | 3:1 | |
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| 30. Journée | 30.03.2024 | USL Dunkerque | - | FC Annecy | 0:2 | |
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| 31. Journée | 06.04.2024 | FC Annecy | - | Valenciennes FC | 2:1 | ||||
| 32. Journée | 13.04.2024 | Stade Lavallois | - | FC Annecy | 0:3 | |
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| 33. Journée | 20.04.2024 | FC Annecy | - | Grenoble Foot 38 | 0:1 | ||||
| 34. Journée | 23.04.2024 | SM Caen | - | FC Annecy | 2:1 | ||||
| 35. Journée | 27.04.2024 | FC Annecy | - | SC Bastia | 3:2 | |
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| 36. Journée | 03.05.2024 | Rodez AF | - | FC Annecy | 1:3 | |
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| 38. Journée | 17.05.2024 | ESTAC Troyes | - | FC Annecy | 1:1 | |
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