| 6. Journée | 01.08.1999 | FC Aarau | - | Servette FC | 3:2 |  |
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| 7. Journée | 07.08.1999 | FC Luzern | - | FC Aarau | 2:1 |  |
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| 9. Journée | 21.08.1999 | FC Zürich | - | FC Aarau | 0:1 | ||||
| 10. Journée | 28.08.1999 | FC Lugano | - | FC Aarau | 4:1 | ||||
| 11. Journée | 11.09.1999 | FC Aarau | - | FC Basel 1893 | 1:3 | ||||
| 12. Journée | 18.09.1999 | FC Aarau | - | Neuchâtel Xamax FC | 4:1 | ||||
| 13. Journée | 26.09.1999 | Yverdon Sport FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 03.10.1999 | FC Aarau | - | Grasshopper Club Zürich | 2:1 | |
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| 17. Journée | 30.10.1999 | Servette FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 18. Journée | 07.11.1999 | FC Aarau | - | FC Luzern | 1:0 | ||||
| 19. Journée | 20.11.1999 | Lausanne Sports | - | FC Aarau | 3:1 | ||||
| 20. Journée | 28.11.1999 | FC Aarau | - | FC Zürich | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 05.12.1999 | FC Aarau | - | FC Lugano | 0:2 | ||||
| 22. Journée | 12.12.1999 | FC Basel 1893 | - | FC Aarau | 2:1 | |
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