| 19. Journée | 12.02.2006 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Thun | 0:0 | ||||
| 20. Journée | 19.02.2006 | FC Thun | - | BSC Young Boys | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 26.02.2006 | FC Zürich | - | FC Thun | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 04.03.2006 | FC Thun | - | FC Basel 1893 | 1:1 | ||||
| 24. Journée | 18.03.2006 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 2:1 |  |
|||
| 25. Journée | 22.03.2006 | FC Thun | - | Grasshopper Club Zürich | 0:1 | ||||
| 26. Journée | 26.03.2006 | FC St. Gallen | - | FC Thun | 1:0 | ||||
| 27. Journée | 02.04.2006 | FC Thun | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 06.04.2006 | FC Aarau | - | FC Thun | 0:1 |  |
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| 29. Journée | 09.04.2006 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 3:1 | |
|
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| 31. Journée | 20.04.2006 | FC Schaffhausen | - | FC Thun | 2:3 | |
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| 32. Journée | 23.04.2006 | FC Thun | - | Yverdon Sport FC | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 29.04.2006 | FC Basel 1893 | - | FC Thun | 2:0 | ||||
| 34. Journée | 03.05.2006 | FC Thun | - | FC Zürich | 1:3 | ||||
| 36. Journée | 14.05.2006 | FC Thun | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 | |
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