| Groupe 3 | 17.02.2021 | CD Águila | - | Jocoro FC | 3:1 |  |
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| Groupe 3 | 21.02.2021 | Luis Ángel Firpo | - | CD Águila | 1:0 | ||||
| Groupe 3 | 06.03.2021 | Municipal Limeño | - | CD Águila | 1:2 | ||||
| Groupe 3 | 10.03.2021 | Jocoro FC | - | CD Águila | 0:1 | |
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| Groupe 3 | 13.03.2021 | CD Águila | - | Luis Ángel Firpo | 0:0 | ||||
| Groupe B | 20.03.2021 | CD Águila | - | Isidro Metapán | 0:2 | ||||
| Groupe B | 31.03.2021 | CD Águila | - | Sonsonate FC | 4:0 | |
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| Groupe B | 04.04.2021 | Municipal Limeño | - | CD Águila | 0:0 | ||||
| Groupe B | 18.04.2021 | Isidro Metapán | - | CD Águila | 1:1 | ||||
| Groupe B | 22.04.2021 | Sonsonate FC | - | CD Águila | 0:1 | ||||
| Groupe B | 24.04.2021 | CD Águila | - | Municipal Limeño | 1:1 | |
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| Groupe B | 28.04.2021 | Santa Tecla FC | - | CD Águila | 1:1 | ||||
| Groupe B | 01.05.2021 | CD Águila | - | AD Chalatenango | 2:1 | ||||
| Quarts de finale | 05.05.2021 | CD Águila | - | Alianza | 0:1 | ||||
| Quarts de finale | 09.05.2021 | Alianza | - | CD Águila | 2:1 | |
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