| 7. Journée | 11.09.2016 | FC Sion | - | FC Thun | 1:0 |  |
|||
| 8. Journée | 20.09.2016 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 1:2 | ||||
| 9. Journée | 25.09.2016 | FC Thun | - | FC Lugano | 2:2 | ||||
| 10. Journée | 01.10.2016 | FC Basel 1893 | - | FC Thun | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 15.10.2016 | FC Thun | - | FC Lausanne-Sport | 1:0 | ||||
| 12. Journée | 22.10.2016 | FC Vaduz | - | FC Thun | 2:3 | ||||
| 13. Journée | 30.10.2016 | FC St. Gallen | - | FC Thun | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 05.11.2016 | FC Thun | - | FC Sion | 2:3 | ||||
| 16. Journée | 26.11.2016 | FC Thun | - | FC Luzern | 1:2 | ||||
| 21. Journée | 18.02.2017 | FC Luzern | - | FC Thun | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 25.02.2017 | FC Thun | - | FC Vaduz | 4:3 |  |
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| 23. Journée | 04.03.2017 | BSC Young Boys | - | FC Thun | 3:2 | ||||
| 24. Journée | 12.03.2017 | FC Thun | - | FC Lugano | 5:2 | ||||
| 25. Journée | 19.03.2017 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 2:2 |
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