| 4. Journée | 17.08.2013 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Borussia Dortmund II | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 24.08.2013 | Borussia Dortmund II | - | Jahn Regensburg | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 03.09.2013 | MSV Duisburg | - | Borussia Dortmund II | 1:2 |  |
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| 9. Journée | 14.09.2013 | Hansa Rostock | - | Borussia Dortmund II | 1:2 | ||||
| 10. Journée | 22.09.2013 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Saarbrücken | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 28.09.2013 | Stuttgarter Kickers | - | Borussia Dortmund II | 3:0 | ||||
| 8. Journée | 02.10.2013 | Borussia Dortmund II | - | SV Darmstadt 98 | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 05.10.2013 | Borussia Dortmund II | - | Hallescher FC | 4:0 | ||||
| 13. Journée | 19.10.2013 | Preußen Münster | - | Borussia Dortmund II | 4:0 | |
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| 14. Journée | 26.10.2013 | Borussia Dortmund II | - | Wacker Burghausen | 3:1 | ||||
| 15. Journée | 02.11.2013 | RB Leipzig | - | Borussia Dortmund II | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 09.11.2013 | Borussia Dortmund II | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:3 | |
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| 17. Journée | 23.11.2013 | SV Wehen Wiesbaden | - | Borussia Dortmund II | 1:1 | ||||
| 18. Journée | 30.11.2013 | Borussia Dortmund II | - | Holstein Kiel | 1:1 | |
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| 21. Journée | 18.12.2013 | VfB Stuttgart II | - | Borussia Dortmund II | 1:2 |
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