| 4. Journée | 22.02.2009 | Boyacá Chicó | - | Independiente Medellín | 3:2 |  |
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| 5. Journée | 01.03.2009 | Deportivo Pereira | - | Boyacá Chicó | 4:0 | ||||
| 6. Journée | 07.03.2009 | Boyacá Chicó | - | La Equidad | 2:0 | |
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| 9. Journée | 22.03.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportes Quindío | 2:2 | |
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| 11. Journée | 12.04.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 20.04.2009 | Millonarios | - | Boyacá Chicó | 0:1 | ||||
| 14. Journée | 23.04.2009 | Atlético Nacional | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 25.04.2009 | Boyacá Chicó | - | Cúcuta Deportivo | 4:0 | ||||
| 15. Journée | 03.05.2009 | Boyacá Chicó | - | Once Caldas | 1:0 |  |
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| 16. Journée | 10.05.2009 | Deportivo Pasto | - | Boyacá Chicó | 0:1 | |
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| 17. Journée | 14.05.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Cali | 1:1 |
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