| 16. Journée | 08.03.2025 | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | - | 1. FC Slovácko [B-jeun] | 1:4 |  |
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| 17. Journée | 14.03.2025 | FC Zlín [B-jeun] | - | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | 2:2 | ||||
| 18. Journée | 22.03.2025 | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | - | Sigma Olomouc [B-jeun] | 1:3 | ||||
| 19. Journée | 28.03.2025 | FC Zbrojovka Brno [B-jeun] | - | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | 2:2 | |
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| 20. Journée | 05.04.2025 | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | - | Banik Ostrava [B-jeun] | 3:0 | |
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| 21. Journée | 12.04.2025 | Dynamo České Budějovice [B-jeun] | - | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | 1:1 | ||||
| 26. Journée | 17.05.2025 | FK Pardubice [B-jeun] | - | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | 3:2 | ||||
| 27. Journée | 24.05.2025 | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | - | Slavia Praha [B-jeun] | 2:1 |
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