| 1. Journée | 15.07.2012 | FK Senica | - | FK Dukla Banská Bystrica | 2:3 | ||||
| 2. Journée | 22.07.2012 | 1. FC Tatran Prešov | - | FK Senica | 2:0 | ||||
| 3. Journée | 29.07.2012 | FK Senica | - | MFK Košice | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 12.08.2012 | FK Senica | - | Spartak Trnava | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 19.08.2012 | Slovan Bratislava | - | FK Senica | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 24.08.2012 | FK Senica | - | Spartak Myjava | 0:1 | ||||
| 9. Journée | 15.09.2012 | MFK Ružomberok | - | FK Senica | 0:2 |  |
|||
| 10. Journée | 22.09.2012 | FK Senica | - | Zlaté Moravce | 3:0 | ||||
| 11. Journée | 30.09.2012 | FC Nitra | - | FK Senica | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 06.10.2012 | FK Dukla Banská Bystrica | - | FK Senica | 1:2 | ||||
| 13. Journée | 20.10.2012 | FK Senica | - | 1. FC Tatran Prešov | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 10.11.2012 | Spartak Trnava | - | FK Senica | 1:1 | ||||
| 17. Journée | 17.11.2012 | FK Senica | - | Slovan Bratislava | 0:1 | ||||
| 18. Journée | 25.11.2012 | Spartak Myjava | - | FK Senica | 1:2 | ||||
| 19. Journée | 02.12.2012 | AS Trenčín | - | FK Senica | 1:1 |
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