| 3. Journée | 12.08.2006 | NK Međimurje | - | NK Osijek | 2:0 | ||||
| 4. Journée | 19.08.2006 | Dinamo Zagreb | - | NK Međimurje | 4:1 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | NK Međimurje | - | HNK Šibenik | 2:1 |  |
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| 6. Journée | 09.09.2006 | NK Pula 1856 | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 7. Journée | 16.09.2006 | NK Međimurje | - | Slaven Belupo | 0:3 | |
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| 8. Journée | 23.09.2006 | NK Međimurje | - | HNK Cibalia | 3:1 | ||||
| 9. Journée | 30.09.2006 | Kamen Ingrad | - | NK Međimurje | 0:2 | |
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| 11. Journée | 21.10.2006 | HNK Rijeka | - | NK Međimurje | 1:3 | ||||
| 13. Journée | 04.11.2006 | NK Međimurje | - | NK Varteks | 5:1 | |
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| 14. Journée | 08.11.2006 | NK Osijek | - | NK Međimurje | 1:1 | |
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| 16. Journée | 18.11.2006 | HNK Šibenik | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 17. Journée | 25.11.2006 | NK Međimurje | - | NK Pula 1856 | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 02.12.2006 | Slaven Belupo | - | NK Međimurje | 1:0 | ||||
| 15. Journée | 09.12.2006 | NK Međimurje | - | Dinamo Zagreb | 2:3 |
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