| Groupe A | 17.09.2016 | Deportivo Municipal | - | Universidad Cesar Vallejo | 2:1 |  |
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| Groupe A | 25.09.2016 | Unión Comercio | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Groupe A | 23.10.2016 | Juan Aurich | - | Deportivo Municipal | 0:2 | ||||
| Groupe A | 04.11.2016 | Universidad Cesar Vallejo | - | Deportivo Municipal | 3:0 | |
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| Groupe A | 19.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Unión Comercio | 2:0 | ||||
| Groupe A | 24.11.2016 | Deportivo Municipal | - | Sporting Cristal | 1:3 | ||||
| Groupe A | 27.11.2016 | Real Garcilaso | - | Deportivo Municipal | 2:1 |
Pérou