| 3. Journée | 04.08.2012 | HNK Cibalia | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 |  |
|||
| 4. Journée | 10.08.2012 | NK Inter Zaprešić | - | NK Osijek | 0:3 | ||||
| 5. Journée | 18.08.2012 | NK Istra 1961 | - | NK Inter Zaprešić | 3:1 | ||||
| 6. Journée | 24.08.2012 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Rijeka | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 01.09.2012 | RNK Split | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 15.09.2012 | NK Inter Zaprešić | - | Hajduk Split | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 22.09.2012 | NK Zadar | - | NK Inter Zaprešić | 1:5 | ||||
| 10. Journée | 29.09.2012 | NK Inter Zaprešić | - | Slaven Belupo | 2:2 | ||||
| 11. Journée | 05.10.2012 | NK Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 20.10.2012 | NK Inter Zaprešić | - | Dinamo Zagreb | 0:2 | ||||
| 20. Journée | 15.02.2013 | NK Inter Zaprešić | - | NK Zadar | 0:1 | ||||
| 21. Journée | 23.02.2013 | Slaven Belupo | - | NK Inter Zaprešić | 2:2 | ||||
| 22. Journée | 01.03.2013 | NK Inter Zaprešić | - | NK Zagreb | 1:2 |
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