| 5. Journée | 20.08.2016 | FC Aarau | - | FC Schaffhausen | 3:2 |  |
|||
| 6. Journée | 27.08.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Zürich | 1:3 | ||||
| 7. Journée | 10.09.2016 | Neuchâtel Xamax FCS | - | FC Schaffhausen | 2:0 | ||||
| 9. Journée | 25.09.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Wohlen | 0:1 | ||||
| 10. Journée | 03.10.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 11. Journée | 16.10.2016 | FC Schaffhausen | - | Servette FC | 1:2 | ||||
| 12. Journée | 23.10.2016 | FC Zürich | - | FC Schaffhausen | 5:2 | ||||
| 13. Journée | 30.10.2016 | FC Le Mont | - | FC Schaffhausen | 1:0 | |
|||
| 14. Journée | 05.11.2016 | FC Schaffhausen | - | Neuchâtel Xamax FCS | 1:4 | ||||
| 15. Journée | 21.11.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Aarau | 2:3 | ||||
| 17. Journée | 04.12.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Chiasso | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 11.12.2016 | FC Wohlen | - | FC Schaffhausen | 4:0 | |
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