| 9. Journée | 17.09.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Alemannia Aachen | 1:1 | ||||
| 10. Journée | 24.09.2016 | Borussia Dortmund II | - | Fortuna Düsseldorf II | 2:2 | ||||
| 13. Journée | 16.10.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Sportfreunde Siegen | 2:2 | ||||
| 14. Journée | 21.10.2016 | SG Wattenscheid 09 | - | Fortuna Düsseldorf II | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 29.10.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 25.11.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Bonner SC | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 16.12.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Rot-Weiss Essen | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 10.02.2017 | Wuppertaler SV | - | Fortuna Düsseldorf II | 5:1 | ||||
| 21. Journée | 18.02.2017 | Bor. Mönchengladbach II | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 25.02.2017 | Rot-Weiss Essen | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:0 | ||||
| 29. Journée | 22.03.2017 | Fortuna Düsseldorf II | - | 1. FC Köln II | 1:2 | ||||
| 26. Journée | 04.04.2017 | Alemannia Aachen | - | Fortuna Düsseldorf II | 1:1 | ||||
| 28. Journée | 09.04.2017 | FC Schalke 04 II | - | Fortuna Düsseldorf II | 4:0 |  |
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