| 1. Journée | 09.02.2025 | Alianza Lima | - | Cusco FC | 3:0 | ||||
| 2. Journée | 14.02.2025 | Cusco FC | - | FBC Melgar | 0:1 | ||||
| 3. Journée | 25.02.2025 | Deportivo Binacional | - | Cusco FC | 1:2 | ||||
| 4. Journée | 01.03.2025 | Cusco FC | - | Universidad Técnica | 1:1 |  |
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| 6. Journée | 28.03.2025 | Alianza Atlético | - | Cusco FC | 2:4 | |
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| 7. Journée | 06.04.2025 | Cusco FC | - | Juan Pablo II College | 4:2 | ||||
| 8. Journée | 13.04.2025 | Sporting Cristal | - | Cusco FC | 1:0 | ||||
| 9. Journée | 20.04.2025 | Cusco FC | - | Ayacucho FC | 3:0 | ||||
| 10. Journée | 28.04.2025 | AD Tarma | - | Cusco FC | 2:1 | ||||
| 11. Journée | 04.05.2025 | Cusco FC | - | Universitario de Deportes | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 12.05.2025 | Deportivo Garcilaso | - | Cusco FC | 1:3 | |
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| 13. Journée | 18.05.2025 | Cusco FC | - | Los Chankas | 3:3 | |
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| 14. Journée | 24.05.2025 | Comerciantes Unidos | - | Cusco FC | 1:2 |  |
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