| 1. Journée | 29.07.2016 | FK Dukla Praha | - | FK Teplice | 0:1 | ||||
| 2. Journée | 06.08.2016 | 1. FC Slovácko | - | FK Dukla Praha | 2:2 |  |
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| 3. Journée | 14.08.2016 | FK Dukla Praha | - | FC Hradec Králové | 3:0 | ||||
| 4. Journée | 20.08.2016 | MFK Karviná | - | FK Dukla Praha | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 28.08.2016 | FK Dukla Praha | - | AC Sparta Praha | 0:2 | ||||
| 6. Journée | 11.09.2016 | FK Jablonec | - | FK Dukla Praha | 1:1 | |
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| 8. Journée | 24.09.2016 | FK Dukla Praha | - | Zbrojovka Brno | 4:2 |  |
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| 9. Journée | 01.10.2016 | FK Mladá Boleslav | - | FK Dukla Praha | 1:0 | ||||
| 10. Journée | 15.10.2016 | FK Dukla Praha | - | Slovan Liberec | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 21.10.2016 | Vysočina Jihlava | - | FK Dukla Praha | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 30.10.2016 | FK Dukla Praha | - | Viktoria Plzeň | 0:1 | |
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| 14. Journée | 18.11.2016 | FK Dukla Praha | - | Slavia Praha | 1:2 | ||||
| 15. Journée | 26.11.2016 | FC Fastav Zlín | - | FK Dukla Praha | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 04.12.2016 | FK Dukla Praha | - | 1. FC Slovácko | 2:3 |
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