| 1. Journée | 21.09.2020 | VfL Bochum | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
| 2. Journée | 27.09.2020 | FC St. Pauli | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 4:2 |  |
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| 3. Journée | 02.10.2020 | SV Sandhausen | - | FC St. Pauli | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 21.03.2021 | VfL Osnabrück | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
| 29. Journée | 17.04.2021 | FC St. Pauli | - | Würzburger Kickers | 4:0 | ||||
| 30. Journée | 21.04.2021 | Fortuna Düsseldorf | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 34. Journée | 23.05.2021 | Jahn Regensburg | - | FC St. Pauli | 3:0 |
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