| 29. Journée | 05.03.2000 | CF Extremadura | - | Villarreal CF | 4:1 |  |
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| 31. Journée | 19.03.2000 | Villarreal CF | - | CD Tenerife | 0:0 | ||||
| 32. Journée | 26.03.2000 | Sporting Gijón | - | Villarreal CF | 1:2 | ||||
| 33. Journée | 02.04.2000 | Villarreal CF | - | Recreativo Huelva | 1:1 |  |
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| 34. Journée | 09.04.2000 | CD Toledo | - | Villarreal CF | 1:3 | ||||
| 35. Journée | 16.04.2000 | Villarreal CF | - | CP Mérida | 1:0 | ||||
| 36. Journée | 23.04.2000 | Atlético Madrid B | - | Villarreal CF | 1:4 | ||||
| 37. Journée | 30.04.2000 | Villarreal CF | - | CD Leganés | 2:0 | ||||
| 38. Journée | 07.05.2000 | CA Osasuna | - | Villarreal CF | 3:1 | ||||
| 39. Journée | 13.05.2000 | Villarreal CF | - | SD Compostela | 1:1 | ||||
| 40. Journée | 20.05.2000 | Córdoba CF | - | Villarreal CF | 2:4 | ||||
| 41. Journée | 28.05.2000 | Villarreal CF | - | UD Las Palmas | 1:1 | ||||
| 42. Journée | 04.06.2000 | CD Logroñés | - | Villarreal CF | 1:0 | |
Espagne