| 8. Journée | 17.09.2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 24.09.2012 | Real Cartagena | - | Atlético Junior | 1:3 | ||||
| 11. Journée | 30.09.2012 | Millonarios | - | Atlético Junior | 2:0 |  |
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| 12. Journée | 04.10.2012 | Atlético Junior | - | Atlético Huila | 4:0 | ||||
| 13. Journée | 06.10.2012 | Deportes Tolima | - | Atlético Junior | 2:2 | |
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| 14. Journée | 18.10.2012 | Atlético Junior | - | La Equidad | 0:0 | |
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| 15. Journée | 22.10.2012 | Cúcuta Deportivo | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 28.10.2012 | Atlético Junior | - | Atlético Nacional | 1:0 |  |
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| 17. Journée | 04.11.2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 2:1 | |
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