| 1. Journée | 15.07.2016 | Slaven Belupo | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 23.07.2016 | NK Inter Zaprešić | - | NK Osijek | 0:2 | ||||
| 3. Journée | 30.07.2016 | HNK Cibalia | - | NK Inter Zaprešić | 3:3 | ||||
| 12. Journée | 15.10.2016 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Cibalia | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 23.10.2016 | HNK Rijeka | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 29.10.2016 | NK Inter Zaprešić | - | Dinamo Zagreb | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 19.11.2016 | NK Inter Zaprešić | - | RNK Split | 2:0 | ||||
| 18. Journée | 05.12.2016 | NK Inter Zaprešić | - | NK Istra 1961 | 2:2 | ||||
| 19. Journée | 09.12.2016 | Slaven Belupo | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 | ||||
| 20. Journée | 16.12.2016 | NK Inter Zaprešić | - | NK Osijek | 2:2 | ||||
| 23. Journée | 04.03.2017 | Dinamo Zagreb | - | NK Inter Zaprešić | 2:0 |  |
|||
| 24. Journée | 10.03.2017 | NK Inter Zaprešić | - | Lokomotiva Zagreb | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 18.03.2017 | RNK Split | - | NK Inter Zaprešić | 0:0 | ||||
| 27. Journée | 09.04.2017 | NK Istra 1961 | - | NK Inter Zaprešić | 1:0 | ||||
| 29. Journée | 21.04.2017 | NK Osijek | - | NK Inter Zaprešić | 2:1 |  |
|||
| 35. Journée | 20.05.2017 | Hajduk Split | - | NK Inter Zaprešić | 6:0 |
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