| 3. Journée | 10.09.2016 | Levadiakos | - | Panathinaikos | 0:3 | ||||
| 4. Journée | 18.09.2016 | Panathinaikos | - | PAS Giannina | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 24.09.2016 | Panetolikos | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 02.10.2016 | Panathinaikos | - | Asteras Tripolis | 3:1 |  |
|||
| 8. Journée | 24.10.2016 | Veria FC | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 30.10.2016 | Panathinaikos | - | AEP Iraklis FC | 2:0 | ||||
| 12. Journée | 27.11.2016 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:1 | |
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