| 2. Journée | 31.07.2016 | FC Zimbru | - | FC Milsami | 1:0 |  |
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| 3. Journée | 06.08.2016 | FC Milsami | - | Dacia Chişinău | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 20.08.2016 | FC Academia UTM | - | FC Milsami | 0:4 |  |
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| 7. Journée | 10.09.2016 | FC Sheriff | - | FC Milsami | 2:0 | ||||
| 8. Journée | 16.09.2016 | FC Milsami | - | CS Petrocub | 5:0 | ||||
| 6. Journée | 21.09.2016 | FC Milsami | - | Speranţa Nisporeni | 4:0 | ||||
| 9. Journée | 25.09.2016 | FC Zaria | - | FC Milsami | 0:2 | |
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| 10. Journée | 30.09.2016 | FC Milsami | - | Dinamo-Auto | 4:1 | ||||
| 11. Journée | 16.10.2016 | FC Milsami | - | CF Ungheni | 4:0 | |
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| 12. Journée | 21.10.2016 | FC Saxan | - | FC Milsami | 0:1 | |
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| 13. Journée | 30.10.2016 | FC Milsami | - | FC Zimbru | 1:0 | |
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| 14. Journée | 05.11.2016 | Dacia Chişinău | - | FC Milsami | 1:1 |
Russie