| 5. Journée | 29.08.2016 | FC Fastav Zlín | - | MFK Karviná | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 09.09.2016 | 1. FC Slovácko | - | FC Fastav Zlín | 1:3 |  |
|||
| 7. Journée | 19.09.2016 | FC Fastav Zlín | - | AC Sparta Praha | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 24.09.2016 | FC Hradec Králové | - | FC Fastav Zlín | 0:2 | ||||
| 9. Journée | 01.10.2016 | FC Fastav Zlín | - | FK Jablonec | 2:2 | |
|||
| 10. Journée | 15.10.2016 | FK Teplice | - | FC Fastav Zlín | 2:0 | ||||
| 11. Journée | 21.10.2016 | FC Fastav Zlín | - | Bohemians Praha 1905 | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2016 | FK Mladá Boleslav | - | FC Fastav Zlín | 1:2 | |
|||
| 13. Journée | 05.11.2016 | FC Fastav Zlín | - | Zbrojovka Brno | 2:1 | |
|||
| 14. Journée | 18.11.2016 | Vysočina Jihlava | - | FC Fastav Zlín | 1:3 | ||||
| 15. Journée | 26.11.2016 | FC Fastav Zlín | - | FK Dukla Praha | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 02.12.2016 | FC Fastav Zlín | - | Slavia Praha | 0:4 |
Bosnie-Herzégovine