| 1er tour | 24.01.2006 | Colo-Colo | - | Deportivo Guadalajara | 1:3 |  |
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| 1er tour | 31.01.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Colo-Colo | 5:3 |  |
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| Groupe 1 | 08.03.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Caracas FC | 1:1 | |
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| Groupe 1 | 22.03.2006 | Deportivo Guadalajara | - | São Paulo FC | 2:1 | ||||
| Groupe 1 | 06.04.2006 | São Paulo FC | - | Deportivo Guadalajara | 1:2 | |
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| Quarts de finale | 21.07.2006 | Vélez Sarsfield | - | Deportivo Guadalajara | 1:2 | |
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| Demi-finales | 27.07.2006 | Deportivo Guadalajara | - | São Paulo FC | 0:1 |
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