| Groupe J | 15.09.2016 | PAOK Saloniki | - | ACF Fiorentina | 0:0 | ||||
| Groupe J | 29.09.2016 | Slovan Liberec | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| Groupe J | 20.10.2016 | Qarabağ FK | - | PAOK Saloniki | 2:0 | ||||
| Groupe J | 03.11.2016 | PAOK Saloniki | - | Qarabağ FK | 0:1 | ||||
| Groupe J | 24.11.2016 | ACF Fiorentina | - | PAOK Saloniki | 2:3 | ||||
| Groupe J | 08.12.2016 | PAOK Saloniki | - | Slovan Liberec | 2:0 | ||||
| Seizièmes de finale | 16.02.2017 | PAOK Saloniki | - | FC Schalke 04 | 0:3 | ||||
| Seizièmes de finale | 22.02.2017 | FC Schalke 04 | - | PAOK Saloniki | 1:1 |
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