| 11. Journée | 23.10.2009 | FC Locarno | - | FC Stade Nyonnais | 1:2 |  |
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| 12. Journée | 31.10.2009 | FC Stade Nyonnais | - | Yverdon Sport FC | 0:4 | ||||
| 13. Journée | 07.11.2009 | FC Lausanne-Sport | - | FC Stade Nyonnais | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 07.03.2010 | FC Lugano | - | FC Stade Nyonnais | 2:1 |  |
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| 16. Journée | 10.03.2010 | FC Stade Nyonnais | - | FC Locarno | 1:1 | ||||
| 23. Journée | 03.04.2010 | FC Stade Nyonnais | - | FC Gossau | 1:0 | ||||
| 24. Journée | 10.04.2010 | FC Stade Nyonnais | - | FC Vaduz | 1:0 | |
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| 25. Journée | 14.04.2010 | FC Winterthur | - | FC Stade Nyonnais | 5:1 | ||||
| 26. Journée | 18.04.2010 | FC Stade Nyonnais | - | FC Lausanne-Sport | 1:2 | ||||
| 27. Journée | 24.04.2010 | FC Wil 1900 | - | FC Stade Nyonnais | 3:3 | ||||
| 28. Journée | 01.05.2010 | SC Kriens | - | FC Stade Nyonnais | 5:3 | ||||
| 29. Journée | 08.05.2010 | FC Stade Nyonnais | - | FC Biel/Bienne | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 15.05.2010 | FC Schaffhausen | - | FC Stade Nyonnais | 1:3 |
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