| 4. Journée | 14.08.2004 | FC St. Pauli | - | VfL Osnabrück | 2:3 | ||||
| 7. Journée | 03.09.2004 | FC St. Pauli | - | 1. FC Union Berlin | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 11.09.2004 | SC Paderborn 07 | - | FC St. Pauli | 0:3 |  |
|||
| 9. Journée | 17.09.2004 | FC St. Pauli | - | Arminia Bielefeld II | 2:1 | ||||
| 11. Journée | 02.10.2004 | FC St. Pauli | - | Fortuna Düsseldorf | 2:1 | ||||
| 12. Journée | 09.10.2004 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 15.10.2004 | FC St. Pauli | - | Chemnitzer FC | 0:0 | ||||
| 14. Journée | 24.10.2004 | Werder Bremen II | - | FC St. Pauli | 2:2 | |
|||
| 15. Journée | 29.10.2004 | FC St. Pauli | - | Preußen Münster | 3:2 | ||||
| 16. Journée | 06.11.2004 | Eintracht Braunschweig | - | FC St. Pauli | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 13.11.2004 | FC St. Pauli | - | VfL Wolfsburg II | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 26.11.2004 | FC St. Pauli | - | Hertha BSC II | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 03.12.2004 | FC St. Pauli | - | Wuppertaler SV | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 23.04.2005 | Chemnitzer FC | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 37. Journée | 28.05.2005 | FC St. Pauli | - | KFC Uerdingen 05 | 2:2 | ||||
| 38. Journée | 04.06.2005 | Hertha BSC II | - | FC St. Pauli | 1:1 |
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