| 2. Journée | 30.08.1998 | AEK Athen | - | Apollon Smyrnis | 3:1 |  |
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| 3. Journée | 13.09.1998 | Panionios GSS | - | Apollon Smyrnis | 4:2 | ||||
| 4. Journée | 20.09.1998 | Apollon Smyrnis | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 1:1 |  |
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| 5. Journée | 27.09.1998 | Veria FC | - | Apollon Smyrnis | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 04.10.1998 | Apollon Smyrnis | - | OFI Heraklion | 1:0 |  |
|||
| 11. Journée | 29.11.1998 | Ionikos Nikea | - | Apollon Smyrnis | 3:0 | ||||
| 14. Journée | 20.12.1998 | Panathinaikos | - | Apollon Smyrnis | 5:0 | ||||
| 20. Journée | 21.02.1999 | Apollon Smyrnis | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 06.03.1999 | Apollon Smyrnis | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 27. Journée | 25.04.1999 | PAOK Saloniki | - | Apollon Smyrnis | 3:1 | ||||
| 28. Journée | 02.05.1999 | Apollon Smyrnis | - | Ionikos Nikea | 1:1 | ||||
| 29. Journée | 09.05.1999 | Aris Saloniki | - | Apollon Smyrnis | 2:1 | ||||
| 30. Journée | 12.05.1999 | AO Kavala | - | Apollon Smyrnis | 0:1 | ||||
| 31. Journée | 16.05.1999 | Apollon Smyrnis | - | Panathinaikos | 1:3 | ||||
| 33. Journée | 23.05.1999 | Apollon Smyrnis | - | Iraklis Saloniki | 1:3 | ||||
| 34. Journée | 30.05.1999 | Skoda Xanthi | - | Apollon Smyrnis | 1:0 |
Grèce