| 1. Journée | 27.08.2006 | Hércules CF | - | Málaga CF | 0:1 |  |
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| 2. Journée | 03.09.2006 | Málaga CF | - | CD Alavés | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 09.09.2006 | Albacete | - | Málaga CF | 2:1 | ||||
| 4. Journée | 16.09.2006 | Málaga CF | - | CD Numancia | 1:2 | ||||
| 5. Journée | 24.09.2006 | Sporting Gijón | - | Málaga CF | 1:3 | ||||
| 6. Journée | 30.09.2006 | Málaga CF | - | UD Las Palmas | 3:1 | |
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| 7. Journée | 08.10.2006 | Ciudad de Murcia | - | Málaga CF | 2:0 | |
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| 8. Journée | 14.10.2006 | Málaga CF | - | Polideportivo Ejido | 1:1 |  |
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| 9. Journée | 22.10.2006 | Xerez CD | - | Málaga CF | 1:0 | |
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| 11. Journée | 04.11.2006 | Lorca Deportiva | - | Málaga CF | 2:2 | |
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| 12. Journée | 12.11.2006 | Málaga CF | - | SD Ponferradina | 1:1 | |
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| 14. Journée | 26.11.2006 | Málaga CF | - | UD Salamanca | 1:0 | |
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| 15. Journée | 02.12.2006 | Málaga CF | - | Real Madrid Castilla | 3:3 | |
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| 16. Journée | 09.12.2006 | UD Vecindario | - | Málaga CF | 1:1 |
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