| 16. Journée | 17.07.2005 | FK Tom Tomsk | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 17. Journée | 24.07.2005 | CSKA Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:0 |  |
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| 18. Journée | 31.07.2005 | FK Tom Tomsk | - | Krylia Sovetov | 4:2 | ||||
| 19. Journée | 06.08.2005 | Zenit St. Petersburg | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | ||||
| 20. Journée | 21.08.2005 | FK Tom Tomsk | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 27.08.2005 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 11.09.2005 | FK Tom Tomsk | - | FK Saturn | 0:3 | ||||
| 23. Journée | 17.09.2005 | Spartak Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 24. Journée | 24.09.2005 | FK Tom Tomsk | - | FK Moskva | 3:2 | ||||
| 25. Journée | 02.10.2005 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 15.10.2005 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 3:0 |  |
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| 27. Journée | 23.10.2005 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 28. Journée | 30.10.2005 | FK Tom Tomsk | - | Dinamo Moskva | 3:2 | |
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| 29. Journée | 06.11.2005 | Alania Vladikavkaz | - | FK Tom Tomsk | 1:2 | |
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| 30. Journée | 19.11.2005 | FK Tom Tomsk | - | Terek Grozny | 2:0 |
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