| 4. Journée | 13.09.2024 | Persis Solo (LI) | - | Madura United | 4:0 | ||||
| 5. Journée | 17.09.2024 | PSBS Biak | - | Madura United | 2:1 |  |
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| 6. Journée | 21.09.2024 | Dewa United FC | - | Madura United | 3:3 | ||||
| 7. Journée | 28.09.2024 | Madura United | - | Persib Bandung | 2:2 | ||||
| 15. Journée | 14.12.2024 | Borneo FC | - | Madura United | 5:0 | ||||
| 17. Journée | 27.12.2024 | PSS Sleman | - | Madura United | 4:0 | ||||
| 19. Journée | 18.01.2025 | Madura United | - | PS Barito Putera | 2:4 | ||||
| 20. Journée | 24.01.2025 | Persita Tangerang | - | Madura United | 1:1 | ||||
| 21. Journée | 01.02.2025 | Madura United | - | Persis Solo (LI) | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 08.02.2025 | Madura United | - | PSBS Biak | 0:0 | ||||
| 26. Journée | 16.03.2025 | PSIS Semarang | - | Madura United | 1:2 |
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