| 1er tour | 18.08.2016 | Atlético Nacional | - | Deportivo Municipal | 1:0 | ||||
| 2e tour | 14.09.2016 | Atlético Nacional | - | Bolívar | 1:0 | ||||
| Quarts de finale | 27.10.2016 | Atlético Nacional | - | Coritiba - PR | 3:1 |  |
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| Demi-finales | 02.11.2016 | Cerro Porteño | - | Atlético Nacional | 1:1 | ||||
| Demi-finales | 25.11.2016 | Atlético Nacional | - | Cerro Porteño | 0:0 |
Colombie