| 1. Journée | 10.03.2007 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Nalchik | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 17.03.2007 | FK Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:0 | ||||
| 7. Journée | 28.04.2007 | FK Tom Tomsk | - | Zenit St. Petersburg | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 05.05.2007 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 12.05.2007 | FK Tom Tomsk | - | Dinamo Moskva | 1:0 | ||||
| 10. Journée | 20.05.2007 | FK Tom Tomsk | - | Krylia Sovetov | 1:2 | ||||
| 11. Journée | 26.05.2007 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 12. Journée | 09.06.2007 | FK Tom Tomsk | - | Rubin Kazan | 2:0 | ||||
| 14. Journée | 24.06.2007 | FK Tom Tomsk | - | Lokomotiv Moskva | 4:2 |  |
|||
| 15. Journée | 01.07.2007 | FK Khimki | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | ||||
| 26. Journée | 07.10.2007 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 1:3 | ||||
| 27. Journée | 20.10.2007 | FK Tom Tomsk | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 30. Journée | 11.11.2007 | Spartak Nalchik | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |
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