| 4. Journée | 27.08.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Cruz Azul | 2:3 |  |
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| 5. Journée | 31.08.2006 | CF Monterrey | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 | ||||
| 6. Journée | 03.09.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 1:1 | |
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| 8. Journée | 14.09.2006 | Gallos Blancos (old) | - | Deportivo Guadalajara | 1:1 | ||||
| 9. Journée | 17.09.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Pumas UNAM | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 25.09.2006 | UAG Tecos | - | Deportivo Guadalajara | 2:1 |  |
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| 11. Journée | 01.10.2006 | Deportivo Guadalajara | - | CF América | 2:0 | |
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| 12. Journée | 08.10.2006 | Monarcas Morelia | - | Deportivo Guadalajara | 3:2 | |
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| 13. Journée | 15.10.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Club San Luis | 1:0 | ||||
| 14. Journée | 22.10.2006 | UANL Tigres | - | Deportivo Guadalajara | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 29.10.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Atlas Guadalajara | 3:1 | ||||
| 16. Journée | 05.11.2006 | Veracruz (old) | - | Deportivo Guadalajara | 3:2 | ||||
| 17. Journée | 12.11.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Jaguares Chiapas | 1:0 |
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