| 18. Journée | 07.02.2000 | Apollon Smyrnis | - | Iraklis Saloniki | 1:0 |  |
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| 19. Journée | 13.02.2000 | Iraklis Saloniki | - | AO Kavala | 2:1 | ||||
| 20. Journée | 21.02.2000 | AO Trikala | - | Iraklis Saloniki | 3:3 | |
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| 21. Journée | 27.02.2000 | Iraklis Saloniki | - | AEK Athen | 3:1 | ||||
| 22. Journée | 05.03.2000 | PAOK Saloniki | - | Iraklis Saloniki | 4:0 | ||||
| 23. Journée | 12.03.2000 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 1:3 |  |
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| 26. Journée | 02.04.2000 | Iraklis Saloniki | - | Paniliakos Pyrgos | 3:1 | ||||
| 27. Journée | 12.04.2000 | Olympiakos Piraeus | - | Iraklis Saloniki | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 16.04.2000 | Iraklis Saloniki | - | Ionikos Nikea | 3:2 | |
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| 29. Journée | 22.04.2000 | Aris Saloniki | - | Iraklis Saloniki | 2:1 | ||||
| 30. Journée | 03.05.2000 | Iraklis Saloniki | - | OFI Heraklion | 0:3 | ||||
| 31. Journée | 07.05.2000 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 3:0 |
Grèce