| 1. Journée | 12.03.2000 | FC Thun | - | FC Baden | 4:0 | ||||
| 2. Journée | 19.03.2000 | FC Baden | - | SR Delémont | 0:2 | ||||
| 3. Journée | 26.03.2000 | FC Aarau | - | FC Baden | 2:0 | ||||
| 4. Journée | 02.04.2000 | FC Baden | - | AC Bellinzona | 0:0 | ||||
| 5. Journée | 08.04.2000 | FC Baden | - | FC Lugano | 0:3 | ||||
| 6. Journée | 15.04.2000 | FC Zürich | - | FC Baden | 1:2 | ||||
| 7. Journée | 21.04.2000 | FC Sion | - | FC Baden | 4:1 |  |
|||
| 9. Journée | 07.05.2000 | FC Baden | - | FC Zürich | 0:1 | |
|||
| 10. Journée | 14.05.2000 | FC Lugano | - | FC Baden | 1:0 |
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