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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Dukla Praha | 14 | 12 | 2 | 0 | 32:5 | 27 | 38 |
| 2 |
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Vysočina Jihlava | 14 | 9 | 5 | 0 | 29:11 | 18 | 32 |
| 3 |
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Tescoma Zlín | 14 | 9 | 3 | 2 | 30:13 | 17 | 30 |
| 4 |
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MFK Karviná | 14 | 8 | 4 | 2 | 29:14 | 15 | 28 |
| 5 |
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AC Sparta Praha B | 14 | 9 | 1 | 4 | 19:12 | 7 | 28 |
| 6 |
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FK Fotbal Třinec | 14 | 8 | 4 | 2 | 18:12 | 6 | 28 |
| 7 |
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FK Baník Sokolov | 14 | 8 | 2 | 4 | 31:22 | 9 | 26 |
| 8 |
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Viktoria Žižkov | 14 | 8 | 2 | 4 | 16:10 | 6 | 26 |
| 9 |
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FC Graffin Vlašim | 14 | 8 | 1 | 5 | 24:16 | 8 | 25 |
| 10 |
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FC Zenit Čáslav | 14 | 6 | 6 | 2 | 22:12 | 10 | 24 |
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FK Sezimovo Ústí | 14 | 7 | 3 | 4 | 22:12 | 10 | 24 | |
| 12 |
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SK Slovan Varnsdorf | 14 | 6 | 6 | 2 | 20:11 | 9 | 24 |
| 13 |
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FK Baník Most | 14 | 5 | 5 | 4 | 19:16 | 3 | 20 |
| 14 |
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SK Kladno | 14 | 5 | 3 | 6 | 19:16 | 3 | 18 |
| 15 |
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1. SC Znojmo | 14 | 5 | 1 | 8 | 14:22 | -8 | 16 |
| 16 |
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FC Hlučín | 14 | 5 | 1 | 8 | 22:31 | -9 | 16 |
| Promotion | |
| Relégation |
