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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Dukla Praha | 8 | 7 | 1 | 0 | 18:2 | 16 | 22 |
| 2 |
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AC Sparta Praha B | 9 | 7 | 1 | 1 | 12:6 | 6 | 22 |
| 3 |
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Vysočina Jihlava | 9 | 6 | 3 | 0 | 18:7 | 11 | 21 |
| 4 |
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Tescoma Zlín | 9 | 6 | 2 | 1 | 17:8 | 9 | 20 |
| 5 |
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FK Fotbal Třinec | 9 | 6 | 2 | 1 | 10:4 | 6 | 20 |
| 6 |
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MFK Karviná | 9 | 5 | 2 | 2 | 18:11 | 7 | 17 |
| 7 |
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Viktoria Žižkov | 9 | 5 | 1 | 3 | 12:8 | 4 | 16 |
| 8 |
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FC Graffin Vlašim | 8 | 5 | 0 | 3 | 15:9 | 6 | 15 |
| 9 |
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SK Slovan Varnsdorf | 8 | 4 | 3 | 1 | 10:4 | 6 | 15 |
| 10 |
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FK Sezimovo Ústí | 8 | 4 | 2 | 2 | 13:5 | 8 | 14 |
| 11 |
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FK Baník Sokolov | 8 | 4 | 2 | 2 | 19:14 | 5 | 14 |
| 12 |
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FC Zenit Čáslav | 9 | 3 | 4 | 2 | 12:9 | 3 | 13 |
| 13 |
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FK Baník Most | 9 | 3 | 3 | 3 | 15:13 | 2 | 12 |
| 14 |
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SK Kladno | 8 | 3 | 2 | 3 | 10:9 | 1 | 11 |
| 15 |
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1. SC Znojmo | 8 | 3 | 1 | 4 | 8:10 | -2 | 10 |
| 16 |
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FC Hlučín | 8 | 2 | 0 | 6 | 14:25 | -11 | 6 |
| Promotion | |
| Relégation |
