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| Classement | » équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Dynamo České Budějovice | 9 | 8 | 0 | 1 | 22:6 | 16 | 24 |
| 2 |
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Vysočina Jihlava | 9 | 7 | 1 | 1 | 17:6 | 11 | 22 |
| 3 |
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MFK Vítkovice | 9 | 7 | 1 | 1 | 13:8 | 5 | 22 |
| 4 |
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FK Pardubice | 9 | 6 | 3 | 0 | 19:4 | 15 | 21 |
| 5 |
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FK Ústí nad Labem | 9 | 6 | 2 | 1 | 17:7 | 10 | 20 |
| 6 |
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FC Hradec Králové | 8 | 6 | 1 | 1 | 16:4 | 12 | 19 |
| 7 |
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Zbrojovka Brno | 9 | 5 | 2 | 2 | 21:8 | 13 | 17 |
| 8 |
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FK Varnsdorf | 9 | 5 | 2 | 2 | 7:3 | 4 | 17 |
| 9 |
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FC Sellier & Bellot Vlašim | 9 | 4 | 3 | 2 | 15:10 | 5 | 15 |
| 10 |
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FK Baník Sokolov | 9 | 4 | 1 | 4 | 14:12 | 2 | 13 |
| 11 |
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Viktoria Žižkov | 9 | 3 | 3 | 3 | 16:16 | 0 | 12 |
| 12 |
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1. SC Znojmo | 10 | 3 | 2 | 5 | 13:13 | 0 | 11 |
| 13 |
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1. SK Prostějov | 10 | 2 | 5 | 3 | 7:9 | -2 | 11 |
| 14 |
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FK Fotbal Třinec | 9 | 3 | 2 | 4 | 10:11 | -1 | 11 |
| 15 |
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MFK Chrudim | 8 | 3 | 1 | 4 | 15:11 | 4 | 10 |
| 16 |
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FK MAS Táborsko | 9 | 2 | 4 | 3 | 12:12 | 0 | 10 |
| Promotion | |
| Play-off | |
| Relégation |
