| Période | Nom | Nom | Pays | Âge | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Entraîneur | ||||||
| 08/2025 - 06/2026 |  | Javier López | Javier López |  | Espagne | 29.08.1975 |
| 11/2023 - 08/2025 |  | Diego Vázquez | D. Vázquez |  | Argentine | 03.07.1971 |
| 09/2023 - 11/2023 |  | César Vigevani | C. Vigevani | | Argentine | 30.08.1974 |
| 02/2023 - 09/2023 |  | Ninrod Medina | N. Medina |  | Honduras | 26.08.1976 |
| 07/2022 - 02/2023 |  | Hernán Medina | H. Medina | | Argentine | 05.09.1974 |
| 11/2013 - 06/2022 | | Diego Vázquez | D. Vázquez | | Argentine | 03.07.1971 |
| 01/2013 - 06/2013 |  | Juan Castillo | J. Castillo |  | Mexique | 31.01.1951 † |
| 01/2012 - 06/2012 |  | José Treviño | J. Treviño | | Mexique | 29.01.1960 |
| 07/2009 - 09/2011 |  | Ramón Maradiaga | R. Maradiaga | | Honduras | 30.10.1954 |
| 01/2009 - 06/2009 | | Juan Castillo | J. Castillo | | Mexique | 31.01.1951 † |
| 01/2008 - 08/2010 |  | Jaime De La Pava | J. De La Pava |  | Colombie | 14.04.1967 |
| 01/2003 - 12/2003 |  | Alejandro Domínguez | A. Domínguez | | Mexique | 09.11.1961 |
| 07/1985 - 06/1987 |  | Rubén Guifarro | R. Guifarro | | Honduras | 15.10.1946 |
CF Motagua