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| H (Match allé) | CSKA Moskva | - | Shakhtar Donetsk | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Shakhtar Donetsk | - | CSKA Moskva | 2:0 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 18:00 | R (match retour): 19.03.2009 18:30 | vainqueur: Shakhtar Donetsk | ||||
| H (Match allé) | Dinamo Kiev | - | Metalist Kharkiv | 1:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Metalist Kharkiv | - | Dinamo Kiev | 3:2 (1:0) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 18:00 | R (match retour): 19.03.2009 18:00 | vainqueur: Dinamo Kiev | ||||
| H (Match allé) | Hamburger SV | - | Galatasaray | 1:1 (0:1) | ||
| R (match retour) | Galatasaray | - | Hamburger SV | 2:3 (1:0) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 18:00 | R (match retour): 19.03.2009 20:30 | vainqueur: Hamburger SV | ||||
| H (Match allé) | Paris Saint-Germain | - | Sporting Braga | 0:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Sporting Braga | - | Paris Saint-Germain | 0:1 (0:0) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 20:15 | R (match retour): 19.03.2009 21:30 | vainqueur: Paris Saint-Germain | ||||
| H (Match allé) | Werder Bremen | - | AS Saint-Étienne | 1:0 (1:0) | ||
| R (match retour) | AS Saint-Étienne | - | Werder Bremen | 2:2 (0:2) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 20:30 | R (match retour): 18.03.2009 20:30 | vainqueur: Werder Bremen | ||||
| H (Match allé) | Udinese Calcio | - | Zenit St. Petersburg | 2:0 (0:0) | ||
| R (match retour) | Zenit St. Petersburg | - | Udinese Calcio | 1:0 (1:0) | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 20:45 | R (match retour): 19.03.2009 18:30 | vainqueur: Udinese Calcio | ||||
| H (Match allé) | Manchester City | - | Aalborg BK | 2:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | Aalborg BK | - | Manchester City | 3:4 (0:0, 2:0, 2:0) tab | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 20:45 | R (match retour): 19.03.2009 21:00 | vainqueur: Manchester City | ||||
| H (Match allé) | Olympique Marseille | - | AFC Ajax | 2:1 (2:1) | ||
| R (match retour) | AFC Ajax | - | Olympique Marseille | 2:2 (1:1, 2:1) ap | ||
| H (Match allé): 12.03.2009 20:45 | R (match retour): 18.03.2009 20:45 | vainqueur: Olympique Marseille | ||||
