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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Karlsruher SC | 34 | 11 | 20 | 3 | 22:9 | 13 | 53 |
| 2 |
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SC Paderborn 07 | 34 | 13 | 14 | 7 | 23:18 | 5 | 53 |
| 3 |
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1. FC Köln | 34 | 11 | 18 | 5 | 22:7 | 15 | 51 |
| 4 |
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FC St. Pauli | 34 | 11 | 17 | 6 | 19:16 | 3 | 50 |
| 5 |
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1. FC Union Berlin | 34 | 11 | 16 | 7 | 22:15 | 7 | 49 |
| 6 |
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SV Sandhausen | 34 | 9 | 22 | 3 | 16:9 | 7 | 49 |
| 7 |
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Fortuna Düsseldorf | 34 | 12 | 13 | 9 | 21:18 | 3 | 49 |
| 8 |
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FSV Frankfurt | 34 | 12 | 11 | 11 | 22:22 | 0 | 47 |
| 9 |
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FC Ingolstadt 04 | 34 | 9 | 19 | 6 | 17:15 | 2 | 46 |
| 10 |
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SpVgg Greuther Fürth | 34 | 10 | 13 | 11 | 22:20 | 2 | 43 |
| 11 |
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VfL Bochum | 34 | 9 | 14 | 11 | 14:19 | -5 | 41 |
| 12 |
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1. FC Kaiserslautern | 34 | 7 | 19 | 8 | 24:22 | 2 | 40 |
| 13 |
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Energie Cottbus | 34 | 9 | 13 | 12 | 20:25 | -5 | 40 |
| 14 |
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VfR Aalen | 34 | 7 | 17 | 10 | 15:22 | -7 | 38 |
| 15 |
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TSV 1860 München | 34 | 5 | 20 | 9 | 15:22 | -7 | 35 |
| 16 |
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Dynamo Dresden | 34 | 4 | 19 | 11 | 14:24 | -10 | 31 |
| 17 |
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Erzgebirge Aue | 34 | 7 | 9 | 18 | 19:32 | -13 | 30 |
| 18 |
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Arminia Bielefeld | 34 | 4 | 16 | 14 | 13:25 | -12 | 28 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
